在试管婴儿的治疗过程中，女性是禁止吸烟的，因为吸烟会导致所需的促性腺激素的用药量增加，同时LH峰水平、获卵数、受精率、种植率相应降低，从而增加了受精失败率和取消周期率。

吸烟造成的影响对于大龄女性来说，影响更大。这说明了吸烟和年龄因素共同加速了卵巢功能的下降，而导致卵子质量的下降。

特别是在胚胎发育这个早期时期，烟草会影响到患者的代谢过程来干扰到二胎的发育，根据相关统计，胎儿染色体畸变与流产、死胎、多发畸形、先天性疾病有着密切关系。

烟草有害物和代谢产物会引起男性精子DNA碎片率增加，或者控制精子生成的基因发生突变，进而导致不育。一旦精子受损，就会影响到受孕，造成死胎、流产或胎儿畸形率增加。

在2012年发布的试管婴儿治疗前的健康咨询指南中，明确将吸烟作为咨询的重点内容，提出减少吸烟和戒烟的孕前准备。

研究表明，吸烟对人的生育及生殖健康的危害在某种程度上是可逆的，戒烟后生育力大都可有不同程度的恢复。吸烟者特别是那些希望成为父亲、母亲的吸烟者，成功戒烟对于自己以及后代的健康都是非常重要的，而成功戒烟也是不孕不育症治疗的一个重要组成部分。